Trefl II Sopot - KS Spójnia Stargard Szczeciński
KSK Noteć Inowrocław - Polski Cukier SIDEn Toruń
KS Basket Piła - King Wilki Morskie Szczecin
SMS PZKosz Władysławowo - Basket Junior Suchy Las
Legia Warszawa - Polfarmex Kutno
BKS Tur Bielsk Podlaski - MKS Znicz Basket Pruszków
SKK Siedlce - MKS Wikana Start SA Lublin
Rosa II Radom - KS Księżak Łowicz
KS Pogoń Prudnik - WKK Wrocław
MKS Drogbruk Kalisz - Intermarche Bricomarche BM SlamStal Ostrów
Exact Systems Śląsk Wrocław - MKS Dąbrowa Górnicza
KS Sudety Jelenia Góra - SKM Muszkieterowie Nowa Sól
GKS Tychy - MCKiS Termo - Rex SA Jaworzno
AZS AWF ggmedia.pl Kraków - PTG Sokół Łańcut
KKS Mickiewicz Romus Katowice - MOSiR BPS Bank KHS Krosno
AZS Politechnika Częstochowa - GTK Fluor Gliwice
W tej rundzie gra 20 drużyn, które wygrały mecze pierwszej rundy oraz 12 drużyn z pierwszej ligi, które pauzowały w pierwszej fazie zmagań.
Intermarché Basket Cup na szczeblu PZKosz prowadzony jest w systemie „przegrywający odpada”. W każdej rundzie zespoły rozgrywają pojedyncze mecze, a pary wyłonione są w drodze losowania. Do IV rundy przy rozstawieniu zastosowanie ma kryterium geograficzne.
Gospodarzem każdego meczu jest drużyna z niższej ligi. W przypadku gdy obie grają w tej samej klasie rozgrywkowej, miejsce rozegrania spotkania wyłaniane jest w drodze losowania.
Cztery najlepsze drużyny rozgrywek na szczeblu PZKosz (1., 2. i 3. liga) zagrają w turnieju finałowym w formule Final Four, którego organizator zostanie wyłoniony po zakończeniu IV rundy.
Trzy najlepsze drużyny Intermarché Basket Cup na szczeblu PZKosz otrzymają prawo gry w rozgrywkach centralnych Pucharu Polski, który organizowany będzie przez Polską Ligę Koszykówki.
Przed rokiem rywalizację na szczeblu PZKosz wygrał PBS Bank Efir Energy Krosno, który w finale pokonał AZS WSGK Kutno. Puchar Polski drugi raz z rzędu wywalczył zaś Trefl Sopot.
Terminarz rozgrywek:
II runda – 6 listopada 2013 r. (środa)
Losowanie III rundy – 7 listopada 2013 r. (czwartek)
III runda – 20 listopada 2013 r. (środa)
Losowanie IV rundy – 21 listopada 2013 r. (czwartek)
IV runda – 4 grudnia 2013 r. (środa)
Przyznanie organizacji turnieju Final Four – najpóźniej 12 grudnia 2013 roku (czwartek)
Final Four PZKosz – 28-29 grudnia 2013 r.
3 najlepsze zespoły awansują do fazy centralnej z u działem zespołów z PLK.
Terminy fazy centralnej prowadzonej przez PLK SA:
Losowanie I rundy centralnej – 3 stycznia 2014 r. (piątek)
I runda – 15 stycznia 2014 r. (środa)
Losowanie II rundy – 16 stycznia 2014 r. (czwartek)
II runda – 5 lutego 2014 r. (środa)
Final Four: 8-9 lutego 2013 r. (sobota–niedziela)