W dwóch grupach (E - dla drużyn z grup A i B oraz F - dla drużyn z grup C i D) drużyny rozgrywają mecze systemem każdy z każdym w dwóch rundach (mecz i rewanż) z drużynami, z którymi nie rywalizowały w Etapie 1. Do klasyfikacji zalicza się również mecze między drużynami, które uczestniczą w rywalizacji Grupy E lub F, z Etapu 1. Drużyny, które zajmą pierwsze miejsca w grupach E i F uzyskują prawo gry w 1 Lidze Mężczyzn. Drużyny, które zajmą drugie miejsca w grupach E i F rozegrają dwumecz barażowy o prawo gry w 1 Lidze Mężczyzn.
O utrzymanie drużyny rozgrywają mecze systemem każdy z każdym w dwóch rundach (mecz i rewanż) w ramach grup, w których rywalizowały w Etapie 1. Do klasyfikacji zalicza się wszystkie mecze z Etapu 1. Drużyny, które zajmą miejsce 11. (Grupa C i D) oraz10. (Grupa A i B) tracą prawo gry w 2 Lidze Mężczyzn.
Awans z grupy A wywalczyły: KSK Noteć Inowrocław, AZS UMK Consus PBDI Toruń, Politechnika Gdańska, Asseco II Gdynia i Trefl II Sopot.
Awans z grupy B wywalczyły: AZS AGH Alstom Kraków, MCS Daniel Gimbaskets 2 Przemyśl, KS Księżak Łowicz, Stalma AZS UMCS Lublin oraz TS Wisła Kraków.
Grupa A
Wyniki sobotnich spotkań:
Awansem
Grupa B
Wyniki sobotnich spotkań: